四世班禪洛桑卻吉
五世達賴也十分欽佩他淵博的宗教知識,也拜其為師,可以說,兩世「師徒緣分」讓二人關係十分密切。
兩人經過商議後決定,派人請阿拉坦汗出兵援助,三方合作抵抗噶舉派的進攻。
阿拉坦汗沒有多想,迅速出兵支援,一場宗教戰爭就此爆發。阿拉坦汗的部隊十分給力,1637年消滅支持藏巴汗的蒙古部落,然後領兵南下入藏,擊敗藏巴汗。
經此一戰,政治上有中央政府支持、軍事上有蒙古人做後盾的格魯派成為藏區宗教地位最高、經濟實力最強、統治範圍最廣的派別。
由於和老師的關係密切,五世達賴並沒有獨享這份政治和經濟榮譽,而是和洛桑卻吉分享統治權。
由於信仰的關係,阿拉坦汗也十分尊重洛桑卻吉,並贈送稱號「班禪博克多」。